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北京大學學報·自然科學版雜志由中華人民共和國教育部主管，國內刊號為：11-2442/N，被北大期刊(中國人文社會科學期刊)、CSCD 中國科學引文數(shù)據(jù)庫來源期刊(含擴展版)、統(tǒng)計源期刊(中國科技論文優(yōu)秀期刊)、知網(wǎng)收錄(中)、維普收錄(中)、萬方收錄(中)、EI 工程索引(美)、CA 化學文摘(美)、SA 科學文摘(英)、JST 日本科學技術振興機構數(shù)據(jù)庫(日)、Pж(AJ) 文摘雜志(俄)、國家圖書館館藏、上海圖書館館藏、等收錄的一本深受大眾喜愛的雙月刊雜志。
雜志獲得過以下榮譽
全國優(yōu)秀科技期刊
中國優(yōu)秀期刊遴選數(shù)據(jù)庫
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫（CJFD）
中科雙高期刊
中國科技期刊優(yōu)秀期刊
北大圖書館收錄期刊
國家期刊提名獎期刊
影響因子是衡量期刊質量的標準之一，以下是北京大學學報·自然科學版雜志近年來影響因子統(tǒng)計表，以供參考：
